A区和B区是两个核心的难度分级区域，代表了完全不同的风险与收益环境。A区是相对安全的维序区，规则上禁止玩家间的PVP攻击，适合刚接触此玩法的玩家进行练手和熟悉机制；而B区则是允许自由PVP的暗区，不仅敌对NPC的强度更高，还需要时刻提防其他玩家的伏击，但产出的物资品质和箱子的价值也相应地更为高级。这种划分让不同实力和冒险倾向的指挥官都能找到适合自己的节奏，不必一开始就承担过高的爆船风险。
进入虫洞后，指挥官可以通过游戏界面清晰地区分这两个区域。在左侧的总览界面中，会明确标注出A区入口和B区入口的标识，A区属于维序区范围，在此区域你基本不用担心来自其他玩家的主动攻击，可以较为安心地完成各类采集或战斗任务。B区则被划定为暗区的一部分，这里取消了玩家进出信息的提示，环境更为未知，不仅需要应对强化过的敌人，还要对可能潜伏的竞争对手保持警惕。无论从哪个虫洞入口进入，只要船型等级相同，最终都可能在同一副本的不同区域相遇，入口的不同主要影响你在虫洞环形结构中的起始位置。
两者的核心差异体现在任务难度、敌对目标强度以及玩家互动规则上。A区的任务相对简单直接，例如小规模的海盗遭遇战或基础的资源采集，让玩家平稳积累经验。B区则会出现更多需要破解密码的废弃前哨站、防御多波次敌人进攻等特殊 ，战斗压力显著增大。在奖励方面，B区掉落的箱子品质普遍优于A区，遵循着高风险高回报的基本原则。最重要的规则区别在于，A区严禁玩家间的互相攻击，是一个受保护的练习场；而B区则完全开放PVP，他人即为潜在威胁，决策时需将生存放在首位。
针对A区和B区的探索，需要采取截然不同的策略并做好充分准备。对于新人指挥官，强烈建议先从A区开始，完整熟悉虫洞的扭曲效应、任务类型和撤离机制。当你准备踏入B区时，组队前往是大幅提升生存率和效率的明智选择，队友之间可以分工协作，共同应对精英敌人或其他玩家团伙。无论进入哪个区域，都必须高度重视虫洞内持续叠加的空间扭曲效应，该效应会严重削弱舰船的能量恢复能力，因此携带足够的回电装备和组件至关重要。在舰船选择上，出于对行动效率和能量管理的驱逐舰和巡洋舰因其灵活的机动性而通常被认为是比大型战列舰更合适的选择。
