完成指挥官任务首先需要推进游戏的主线剧情，其中最关键的是完成第二场梦系列任务。这个任务是解锁指挥官控制权的基础，在完成后玩家就可以通过按下键盘上的5键来切换出指挥官进行操控，不过这时候的指挥官能力还比较有限，主要是以虚影形态出现并与战甲进行联动。这个系列任务会带领玩家深入了解Tenno的起源故事，是游戏中非常重要的剧情转折点，揭示了玩家角色的真实身份并引入了专精系统的概念。
完成第二场梦后下一步需要着手进行内战任务，这个任务会进一步扩展指挥官的操控能力。内战任务通常需要先解锁特定的星球节点并满足前置条件，比如完成某些枢纽挑战。在任务过程中玩家需要追踪特定的目标，击败沿途的敌人，并最终在关键场景中做出选择以推进剧情。完成内战任务后指挥官就可以完全脱离战甲独立行走和移动，并获得一些额外的技能和战斗选项，比如虚空冲刺和隐匿等能力，这些在后续的战斗中非常实用。
内战任务的完成指挥官还将解锁更丰富的功能，包括与轨道飞行器中的传识之间互动，以及通过专精系统来学习和强化不同的流派能力。玩家可以在飞船的指挥官选项里自定义外观和装备，这些设置会影响到指挥官在任务中的表现和视觉效果。指挥官与战甲之间的切换变得更加流畅，玩家可以根据战斗需要随时调用指挥官来应对不同的战场情况。
为了完全发挥指挥官的潜力还需要完成夜羽系列任务来开放完整的专精系统。专精系统分为五种不同的流派，每种都有独特的技能树和发展方向，玩家可以通过积累专精点数来逐步提升这些能力。在掌握了基本操作后玩家可以进一步探索指挥官的移动和战斗技巧。指挥官在移动时会消耗体力值，因此合理规划路线和使用虚空冲刺来规避敌人是非常必要的。在复杂的地形中利用高低差和掩体可以有效提高生存率，同时结合战甲的技能来创造战术优势是很常见的玩法。灵活运用指挥官的技能可以在 扭转战局，比如在敌人密集时使用虚空隐匿来重新定位。
